杏林灣流域將建設12座污水處理站,6個污水泵站,這些設施啟用后,從上游的許溪至杏林灣,將全面實現截污。
杏林灣整治將在集杏海堤原來的開口處旁,重新開一個口,原來的出水口封閉,水流只出不進。屆時,坂頭水庫的水將流入杏林灣,再流入海中。在保證杏林灣內的淡水不受破壞的同時,避免海水回潮帶來的種種不利因素。